她1966年毕业于上海市戏曲学校。是当时班级里的高材生。在校期间她师承松雪芳老师习武旦。后又受到杨畹农老师和魏莲芳老师的指教。艺术上能文善武,富于创新,善于刻画人物。近年来创作演出了不少新剧目,如《八仙过海》《青石山》《活捉》等都受到了观众的热烈欢迎。特别是代表作《盘丝洞》,文武兼备,用靠旗打出手,更是受到广大京剧观众的称赞,港台同行对她评价也很高。方小亚她还是1982年的上海市三八红旗手和1991年的上海市劳动模范。在艺术上也多次获得上海市和文化部,以及中央电视台所颁发的大奖。她多次随团出国访问演出,曾去过西德,英国,荷兰,比利时,奥地利,瑞士,苏联,日本等地区和国家,以她精湛的演技,倾倒了外国观众。
方小亚1978年参加上海市青年演员汇报演出《闪光的呆子》荣获“优秀演出奖”。1980年参加戏曲片《白蛇传》的拍摄,扮演“小青”,该片荣获文化部颁发的“优秀影片奖”。1986年参加了第三届上海戏剧节演出《八仙过海》荣获“主演奖”。1986年参加上海电视台主办的“戏曲武功艺术电视比赛”荣获“优秀武戏演员”称号。1989年演出《盘丝洞》荣获上海市首届戏剧表演艺术“白玉兰奖”的“主角奖”。1990年演出《盘丝洞》获文化部首届“文华奖”的“优秀主演奖”。1991年参加全国中青年京剧电视大奖赛,演出《青石山》《活捉》获“最佳表演奖”。
1949迁往上海。1959年,方小亚考入上海市戏曲学校京剧班,受教于松雪芳老师,学习京剧武旦艺术,后又受到杨畹农老师和魏莲芳老师的指教,在唱功方面又了长足的进步,打下了扎实的基础。1966年从戏校毕业进入《智取威虎山》剧组,后随剧组并入上海京剧院。1978年,参加上海市青年演员汇报演出,获得“优秀演出奖”；1980年,参加京剧电影艺术片《白蛇传》的拍摄,饰演小青,受到观众一致好评；1985年,在上海市第三届戏剧节中以《八仙过海》一剧获得“主演奖”；1986年,在上海电视台主办的戏曲武功艺术比赛中被授予“优秀武功演员”称号；1988年,参加新编神话京剧《盘丝洞》的创排,在剧中分别饰演女儿国国王和蜘蛛精,以扎实的唱念和表演,繁重的武打和出手,成功塑造了女儿国国王和蜘蛛精的形象,并因为在此剧中的突出表现,获得首届上海白玉兰戏剧表演艺术“主角奖”和文化部首届“文华表演奖”。《盘丝洞》也获得首届“文华剧目”奖,成为上海京剧院的保留,常演剧目,演出场次超过500场,受到上海市委宣传部的特别嘉奖；1991年,参加全国优秀中青年京剧演员电视大奖赛,演出《青石山》《活捉》,获得“最佳表演奖”；1992年,参加梅兰芳金奖大赛,获“金奖”；2000年,参加现代京剧《热血悲情》的创排,饰演贩毒集团总裁,演反面人物而不是演反面符号,有血有肉,人性化地塑造了该人物的内心复杂情感。方小亚在艺术上善武能文,长于刻画人物。武功深厚,身段优美,出手稳健,勇于创新,在唱,念,做,打各方面都颇有建树。经常主演的传统剧目有《青石山》《火凤凰》《八仙过海》《水漫金山》《据大缸》《十八扯》等。曾随团出访西德,英国,荷兰,比利时,奥地利,瑞士,苏联,日本等地区和国家,以她精湛的演技,倾倒了外国观众。特别是1998年的赴日本演出,携《盘丝洞》在日本演出50多天,演出30余场,轰动日本。
1982年2月11日,农历壬戌年正月十八日：上海京剧院三团首演《岳云》上海京剧院三团创编大型古代戏《岳云》在劳动剧场首演。编剧：刘梦德,导演：孔小石,主演：陈蔚,方小亚。1984年6月,农历甲子年：邓宛霞1984年赴沪演出《白蛇传》香港邓宛霞在上海中国大戏院与蔡正仁,方小亚,盛燮昌等合作演出《白蛇传》。1985年11月1日,农历乙丑年九月十九日：上海京剧院1985年赴京演出11月1日至15日,上海京剧院三团赴京汇报演出。在北京工人俱乐部公演了7场。主要剧目有《打金砖》《汉武哭宫》《红桃山》《击鼓骂曹》《乾元山》《天女散花》《雁荡山》《盘丝洞》。主要演员有言兴朋,方小亚,赵国华,张达发,赵京茹等。1991年11月,农历辛未年：第二届全国中青年京剧演员电视大赛闭幕由中央电视台及各省市自治区电视台主办,中国戏剧家协会协办的第二届全国中青年京剧演员电视大赛闭幕。共评出25名最佳表演奖及26名优秀表演奖。
最佳表演奖获奖名单中年组：薛亚萍,方小亚,邓沐玮,王平,高牧坤,白涛,张岚,吴建平,李莉,宋昌林青年组：于魁智,王晓燕,艾金梅,年金鹏,李军,李胜素,李佩红,杨千里,杨玉洁,张建国,陆宝林,孟广禄,郭跃进,耿巧云,秦占宝优秀表演奖获奖名单中年组：任德川,龚苏萍,江燕,林桂兰,陈少云,杨葆荣,刘莉莉,樊琦,胡为之,熊一华青年组：何威,张克,高颂,赵秀君,李晓兰,陈淑芳,王润菁,史敏,王诒,郑子茹,郭玉琴,赵永墩,魏建海,赵飞,胡正中,张月明1992年12月,农历壬申年：梅兰芳金奖大赛旦角组评选揭晓在北京开始举行的梅兰芳金奖大赛旦角组评选结果揭晓。本次大赛实为第三届全国电视京剧大赛,冠名梅兰芳金奖大赛,为期三年。不限年龄,分3组9个行当进行。获奖名单金奖刘长瑜,李维康,杨淑蕊,刘琪,孙毓敏,薛亚萍,方小亚,王继珠,杨至芳提名奖迟小秋,黄孝慈,王蓉蓉,黄小萍,王玉兰,钟荣,江燕1994年4月29日,农历甲戌年三月十九日：天蟾京剧中心逸夫舞台开台祝贺演出举行上海天蟾京剧中心逸夫舞台开台祝贺演出于4月29日至5月5日举行。上海的尚长荣,李炳淑,汪正华,王正屏,夏慧华,艾世菊,蔡正仁,方小亚,王梦云,奚中路,史敏,李军,来自京津等地的梅葆玖,谭元寿,马长礼,李世济,孙毓敏,杨春霞,叶少兰,刘长瑜,张春华,赵麟童,王晶华,李庆春,梅葆玥,李长春,董文华,寇春华和香港票友金如新,钱江,李尤婉云,李和声,谢许萍苏等参加演出。2000年4月7日,农历庚辰年三月初三日：上海京剧院庆祝建院45周年系列演出第八天上海京剧院庆祝建院45周年系列演出举行,第六天在逸夫舞台由剧院主要演员反串演出《八蜡庙》,何澍演费德功,尚长荣演张荣兰,关怀演朱光祖,史敏演褚彪,方小亚演黄天霸。演出盛况空前,剧场出现少有的轰动场面。2000年8月20日,农历庚辰年七月廿一日：2000年上海京剧院赴香港演出8月20日至8月29日,应香港上海戏曲协会的邀请,由上海京剧院总经理林宏鸣任团长的赴香港演出团一行百人在香港文化中心大剧院演出《曹操与杨修》《盘丝洞》《钟馗嫁妹》《青石山》等剧。共演出7场,效果热烈。主要演员有尚长荣,关怀,孙正阳,奚中路,方小亚,夏慧华等。2005年4月28日,农历乙酉年三月二十日,19时15分：庆祝上海京剧院建院50年演出第一天庆祝上海京剧院建院50年演出第一天,为新创剧目优秀唱段大型演唱会。特邀嘉宾：李玉茹,周少麟,张学津。
2007年11月29日,农历丁亥年十月二十日：言慧珠表演艺术教学成果研讨展演大型京昆演唱会暨开幕式举行言慧珠表演艺术教学成果研讨展演大型京昆演唱会暨开幕式在逸夫舞台举行。金锡华,方小亚,方菲主持。演出节目彩唱“行云流水”京剧梅派联唱昆曲《牡丹亭·惊梦》京剧《四郎探母·坐宫》昆曲《白蛇传·水斗》昆曲《百花赠剑》清唱京剧《西施》昆曲《紫钗记·折柳》京剧《沙家浜·智斗》昆曲《南柯记·瑶台》京剧《芦花河》,反串《让徐州》昆曲《长生殿·弹词》京剧《穆桂英挂帅》京剧《霸王别姬》京剧《牛皋下书》,《盗马》京剧《贵妃醉酒》